RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PAX4O43316 350 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 PAX2Q02962 417 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 OCC1Q8TAD7 63 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 GP9P14770 177 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00587B1AMM8 73 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 IGKCP01834 107 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 H3BUA1 57 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 D6R8Y8 96 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 STAG3L3P0CL85 134 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 SVILO95425 2214 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 PRR31Q5SQ13 230 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 C22orf46C9J442 243 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 PLXNA2O75051 1894 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 LINC00614P0C842 121 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 LINC00311Q8N616 119 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 THAP8Q8NA92 274 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 DKK4Q9UBT3 224 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 QRFPP83859 136 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 FOXE3Q13461 319 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZS49 121 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 GATD1Q8NB37 220 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0J9YY99 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 PLNP26678 52 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 C15orf62A8K5M9 175 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 CDKN1BP46527 198 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 C8orf49Q96NF6 230 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 GAGE6Q13070 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 IGLV2-23P01705 113 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 PDE6HQ13956 83 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GV72 72 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 NIT1Q86X76 327 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087WWC5 75 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 Q86TA4 180 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 PIFOQ8TCI5 191 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 C14orf144Q96I85 54 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRB-204ENST00000538708 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 F8W735 103 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 MMP23AO75900 390 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 LIME1Q9H400 295 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-204ENST00000538708 SPRNQ5BIV9 151 aa7.53□□□□□ -1.2
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