RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.81□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.81□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.81□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC17A3O00476 420 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 DEFA1P59665 94 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 DEFA3P59666 94 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 PSG9Q00887 426 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 STX12Q86Y82 276 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 GGACTQ9BVM4 153 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 MEOX2P50222 304 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 Q6ZTC4 211 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 GPR82Q96P67 336 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.8□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 H3BQ15 152 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 PRAF2O60831 178 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 MIFP14174 115 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 CXCL3P19876 107 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 S100A11P31949 105 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 B2MP61769 119 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 AMTNQ6UX39 209 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 BAP18Q8IXM2 172 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 RFNGQ9Y644 331 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 IGLL5B9A064 214 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 PRAC2D3DTV9 90 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 RHOBP62745 196 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 VWC2Q2TAL6 325 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF126Q9BV68 326 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 NMES1Q9C002 83 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 ALG5Q9Y673 324 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 RLN2P04090 185 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 HBG1P69891 147 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 HBG2P69892 147 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 RAB31Q13636 194 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 PSG3Q16557 428 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 C12orf74Q32Q52 190 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 Q6ZRG5 221 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A087X0K7 114 aa7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 E5RGE8 158 aa7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 J3KRW8 73 aa7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 PYYP10082 97 aa7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 S100A7P31151 101 aa7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 KIR3DS1Q14943 382 aa7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.77□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 BLNKQ8WV28 456 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 MBD2Q9UBB5 411 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 MPC2O95563 127 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 HTN1P15515 57 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 IGLC2P0DOY2 106 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 HTN3P15516 51 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 FCN2Q15485 313 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 ATP6V1FQ16864 119 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 LCN15Q6UWW0 184 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD42-209ENST00000533342 A8MTW9 85 aa7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms