RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, human

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226		G3V3Q6	166 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226		H3BQ15	152 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF266	Q14584	549 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	RARRES2	Q99969	163 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226		A8MTW9	85 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	C3orf84	H3BNL1	204 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLC17A3	O00476	420 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	IGKV3-20	P01619	116 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	HLA-DMB	P28068	263 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	PSG3	Q16557	428 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	GUK1	Q16774	197 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	OR11H2	Q8NH07	326 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226		A0A0J9YWU9	116 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226		H3BTX0	84 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF253	O75346	499 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	PSG9	Q00887	426 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	XCL2	Q9UBD3	114 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	PYY	P10082	97 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	FXYD7	P58549	80 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	MFF	Q9GZY8	342 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	RHOB	P62745	196 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	PDE6H	Q13956	83 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ARPC5	O15511	151 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	M6PR	P20645	277 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	CASC10	Q5T4H9	136 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226		X6R8D5	127 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	NDUFB4	O95168	129 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	MIF	P14174	115 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226		Q8NAQ8	132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	OR7C2	O60412	319 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	TAS2R45	P59539	299 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	RAB2A	P61019	212 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	AMBP	P02760	352 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	OR10J4	P0C629	311 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN3-208	ENST00000531226		A0A1W2PPV4	95 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	TAAR5	O14804	337 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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