RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC32Q9BV29 185 aa11.48□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 CDK2AP2O75956 126 aa11.47□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 IL7P13232 177 aa11.47□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.47□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 C16orf74Q96GX8 76 aa11.47□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.46□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 CXCL3P19876 107 aa11.46□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 SELENOTP62341 195 aa11.46□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 PPP1R1AQ13522 171 aa11.46□□□□□ -0.57
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF846Q147U1 533 aa11.46□□□□□ -0.57
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ITGA3-211ENST00000508100 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.45□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.45□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 RNF141Q8WVD5 230 aa11.45□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 PSENENQ9NZ42 101 aa11.45□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 RNF24Q9Y225 148 aa11.45□□□□□ -0.58
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ITGA3-211ENST00000508100 INPP1P49441 399 aa11.44□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 SSX7Q7RTT5 188 aa11.44□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.44□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 UHRF2Q96PU4 802 aa11.44□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.43□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 CDKN1BP46527 198 aa11.43□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 PLP1P60201 277 aa11.43□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 ID3Q02535 119 aa11.43□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 OR5I1Q13606 314 aa11.43□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 ARL6Q9H0F7 186 aa11.43□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 Q9H8V8 135 aa11.43□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 H7BYZ3 331 aa11.42□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 ADAP1O75689 374 aa11.42□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC28AQ8IWP9 274 aa11.42□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.41□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.41□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 SSSCA1O60232 199 aa11.41□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 DLK1P80370 383 aa11.41□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 TTC32Q5I0X7 151 aa11.41□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM8Q96KF7 97 aa11.41□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 ARV1Q9H2C2 271 aa11.41□□□□□ -0.58
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ITGA3-211ENST00000508100 PLA2G10O15496 165 aa11.4□□□□□ -0.58
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ITGA3-211ENST00000508100 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.4□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 TEPPQ6URK8 271 aa11.4□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 LCN15Q6UWW0 184 aa11.4□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.4□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.4□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.4□□□□□ -0.58
ITGA3-211ENST00000508100 C9orf170A2RU37 121 aa11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 GOSR2O14653 212 aa11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.39□□□□□ -0.59
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ITGA3-211ENST00000508100 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0J9YY99 117 aa11.38□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.38□□□□□ -0.59
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ITGA3-211ENST00000508100 FNDC10F2Z333 226 aa11.38□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 K7EPK0 472 aa11.38□□□□□ -0.59
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ITGA3-211ENST00000508100 RLN2P04090 185 aa11.38□□□□□ -0.59
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ITGA3-211ENST00000508100 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.38□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF546Q86UE3 836 aa11.38□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.38□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF503Q96F45 646 aa11.38□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 GAGE12BA1L429 117 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 COX7A2P2O60397 106 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 GAGE7O76087 117 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFB6O95139 128 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 SCGB1D2O95969 90 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 GAGE12FP0CL80 117 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 GAGE12GP0CL81 117 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 GAGE12IP0CL82 117 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 ASAH1Q13510 395 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 Q8N1X5 172 aa11.37□□□□□ -0.59
ITGA3-211ENST00000508100 IFITM3Q01628 133 aa11.36□□□□□ -0.59
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