RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 PSG9Q00887 426 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CLINT1Q14677 625 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF709Q8N972 641 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 THAP6Q8TBB0 222 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PFDN5Q99471 154 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 NPCDR1Q9BY65 106 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC35B3Q9H1N7 401 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAV5A0A0B4J249 113 aa12.23□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PET100P0DJ07 73 aa12.23□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.23□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 MIFP14174 115 aa12.23□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CXCL3P19876 107 aa12.23□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF738Q8NE65 137 aa12.23□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 LCE6AA0A183 80 aa12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 MBD2Q9UBB5 411 aa12.22□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 A8MTW9 85 aa12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 H3BTX0 84 aa12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CXCL2P19875 107 aa12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CNN1P51911 297 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PSG3Q16557 428 aa12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 LCN15Q6UWW0 184 aa12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 HSPB11Q9Y547 144 aa12.21□□□□□ -0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 DNAH1Q9P2D7 4330 aa12.21□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 NUPR2A6NF83 97 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 H3BQ15 152 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 IGLC2P0DOY2 106 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 RPL12P30050 165 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 FCN2Q15485 313 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 GCSAMLQ5JQS6 135 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 AMTNQ6UX39 209 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 OR11H7Q8NGC8 314 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 MFFQ9GZY8 342 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 MED28Q9H204 178 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 HRH4Q9H3N8 390 aa12.2□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 ALMS1Q8TCU4 4167 aa12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC17A3O00476 420 aa12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 ATP5SQ99766 215 aa12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC50A1Q9BRV3 221 aa12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 SMIM3Q9BZL3 60 aa12.19□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 OR8A1Q8NGG7 326 aa12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 HYDINQ4G0P3 5121 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 JTBO76095 146 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 GUK1Q16774 197 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 NEU1Q99519 415 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNIP2Q9NS61 270 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF586Q9NXT0 402 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.17□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 C17orf112F2Z3M2 114 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 M0R2Z0 102 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 RHOBP62745 196 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 RGS21Q2M5E4 152 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.16□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 PRAC2D3DTV9 90 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 IFNA5P01569 189 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 AMBPP02760 352 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 PYYP10082 97 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 MIR17HGQ75NE6 70 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 SCGB1C1Q8TD33 95 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC25A2Q9BXI2 301 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 WFDC1Q9HC57 220 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 CELA1Q9UNI1 258 aa12.15□□□□□ -0.46
KCNQ1-205ENST00000496887 TRBV19A0A075B6N1 114 aa12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 CRXO43186 299 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 RFNGQ9Y644 331 aa12.14□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF253O75346 499 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 INSP01308 110 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 EMP1P54849 157 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 FFAR4Q5NUL3 377 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 BAP18Q8IXM2 172 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 BLNKQ8WV28 456 aa12.13□□□□□ -0.47
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms