RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	THYN1	Q9P016	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0G2JLM5	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GV50	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		C9JQL5	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BQ15	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL4	P05112	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORM2	P19652	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	M6PR	P20645	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMT	P48728	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYZ	P61626	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERF2	P84101	59 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZRG5	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BTX0	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL24	O00175	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA4	O00483	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	HYPM	O75409	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSN3	P07498	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PYY	P10082	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	GP9	P14770	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYBB3	P26998	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SELENOT	P62341	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01619	G3V211	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC17A3	O00476	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHEK1	O14757	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYB5B	O43169	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	BUB3	O43684	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNA7	P01567	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C4BPB	P20851	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPPC	P23582	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8WTZ3	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	RARRES2	Q99969	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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