RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 OR10J1P30954 320 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 S100A11P31949 105 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CAMLGP49069 296 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 HBG1P69891 147 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 HBG2P69892 147 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RUNX1Q01196 453 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 BAXQ07812 192 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 MIC13Q5XKP0 118 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 MGST2Q99735 147 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ATP5SQ99766 215 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RSG1Q9BU20 258 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 UQCC1Q9NVA1 299 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0D9SG52 128 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0G2JLM5 398 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FAM223BA6NKX1 122 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 H3BUA1 57 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CORTO00230 105 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 AGPAT2O15120 278 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CYB5BO43169 146 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TGOLN2O43493 480 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 BCL2L11O43521 198 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CLN5O75503 358 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 YIF1AO95070 293 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1-17P01599 117 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGLC1P0CG04 106 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ATP6V0CP27449 155 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ATP6V1FQ16864 119 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 KLK9Q2XQG4 91 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 STHQ8IWL8 128 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 COMMD1Q8N668 190 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 C3orf56Q8N813 242 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR11H1Q8NG94 326 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR4X1Q8NH49 305 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 USMG5Q96IX5 58 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CXorf58Q96LI9 332 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 DOK5Q9P104 306 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ATRQ13535 2644 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GUS0 222 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 H7C423 109 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 I3L521 148 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 DFFBO76075 338 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 BRI3O95415 125 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IFNA5P01569 189 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RD3LP0DJH9 198 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ORM2P19652 201 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SYNJ2BPP57105 145 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 LYZP61626 148 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF345Q14585 488 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.55□□□□□ -1.84
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