RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 ARV1Q9H2C2 271 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 SERF2P84101 59 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 PATE2Q6UY27 113 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 ST8SIA2Q92186 375 aa8.49□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 U3KQE9 123 aa8.49□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 BAP18Q8IXM2 172 aa8.48□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.48□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.48□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 FAM78BQ5VT40 261 aa8.47□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-217ENST00000481875 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.47□□□□□ -1.05
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GARNL3-217ENST00000481875 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.46□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 HELTA6NFD8 242 aa8.46□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 H3BRN7 92 aa8.46□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 SEC11BP0C7V7 166 aa8.46□□□□□ -1.06
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GARNL3-217ENST00000481875 MORN5Q5VZ52 161 aa8.44□□□□□ -1.06
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GARNL3-217ENST00000481875 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.44□□□□□ -1.06
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GARNL3-217ENST00000481875 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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GARNL3-217ENST00000481875 UMAD1C9J7I0 102 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 OR7C2O60412 319 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
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