RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 H3BMM0 161 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 IGKV3-20P01619 116 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 FXYD7P58549 80 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 C17orf77Q96MU5 243 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 LINC00052Q96N35 136 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 DOK5Q9P104 306 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 XCL2Q9UBD3 114 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 TAAR5O14804 337 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 SPP1P10451 314 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 PSMB3P49720 205 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 MIC13Q5XKP0 118 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A22Q9H936 323 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.41□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 A0A087X0K7 114 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 F6UB75 175 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 ISLRO14498 428 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 SOCS3O14543 225 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 CXCL2P19875 107 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 PATE2Q6UY27 113 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 C20orf173Q96LM9 149 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.4□□□□□ -0.9
HPS1-211ENST00000478087 HMSDA8MTL9 139 aa9.39□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 ZNF345Q14585 488 aa9.39□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 GUK1Q16774 197 aa9.39□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 Q5BKY6 102 aa9.39□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.39□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.39□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.39□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 CELA1Q9UNI1 258 aa9.39□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 RNF222A6NCQ9 220 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 HLA-DRB4P13762 266 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 HLA-DMBP28068 263 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 LCN15Q6UWW0 184 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 UHRF2Q96PU4 802 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 RSG1Q9BU20 258 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 MFFQ9GZY8 342 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.38□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 A0A0D9SG52 128 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 IGLL5B9A064 214 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 G3V3Q6 166 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 MBP02144 154 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 MIFP14174 115 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 SERF2P84101 59 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZTC4 211 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 C16orf92Q96LL3 132 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.37□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 ARPC5O15511 151 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 ZNF253O75346 499 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 TAS2R45P59539 299 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 RHOBP62745 196 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 FAM78BQ5VT40 261 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 HRH4Q9H3N8 390 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 WFDC1Q9HC57 220 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 RPRMQ9NS64 109 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 APLNQ9ULZ1 77 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 FUT9Q9Y231 359 aa9.36□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 M6PRP20645 277 aa9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 PDE6HQ13956 83 aa9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 C12orf74Q32Q52 190 aa9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.35□□□□□ -0.91
HPS1-211ENST00000478087 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.34□□□□□ -0.91
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