RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475614.6

CCDC30-208, Transcript of coiled-coil domain containing 30, human

TSL 2

Gene CCDC30, Length 1,001 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC30-208	ENST00000475614	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	HYPM	O75409	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ORM2	P19652	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	S100A7	P31151	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614		Q6ZRG5	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	PFDN5	Q99471	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	HELT	A6NFD8	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	BCL2L11	O43521	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	OR5G3	P0C626	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GP9	P14770	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GPR82	Q96P67	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	DOK5	Q9P104	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614		A0A087X0K7	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614		K7EQG2	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SOCS3	O14543	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SPP1	P10451	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SERF2	P84101	59 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TWIST1	Q15672	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC30-208	ENST00000475614	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614		A8MZ25	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614		K7EIL1	84 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	M6PR	P20645	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	ZNF253	O75346	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	MB	P02144	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	CD7	P09564	240 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	GALR1	P47211	349 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCDC30-208	ENST00000475614	MEOX2	P50222	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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