RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880		X6R8D5	127 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	LY6G6C	O95867	125 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf77	Q96MU5	243 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PFDN5	Q99471	154 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PET100	P0DJ07	73 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	H2BFS	P57053	126 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	OPCML	Q14982	345 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087X0K7	114 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880		H0YIZ8	118 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880		M0R2Z0	102 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	CXCL3	P19876	107 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PRR20E	P86478	221 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PRR20C	P86479	221 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PRR20D	P86480	221 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PRR20B	P86481	221 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PRR20A	P86496	221 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	PSG3	Q16557	428 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SSR4-208	ENST00000471880	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	IGLL5	B9A064	214 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	MPDU1	O75352	247 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	MPC2	O95563	127 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	INS	P01308	110 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	HBE1	P02100	147 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	CELA1	Q9UNI1	258 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	SLC17A3	O00476	420 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	PTTG1	O95997	202 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	CXCL2	P19875	107 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZTC4	211 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	BAP18	Q8IXM2	172 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880		H3BQ15	152 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA5	P01569	189 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	AMBP	P02760	352 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	HTN1	P15515	57 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	RRN3P1	Q2M238	152 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5S	Q99766	215 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	MED28	Q9H204	178 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880		J3KRW8	73 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	PYY	P10082	97 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	GUK1	Q16774	197 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.65	□□□□□ -0.7

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