RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 XCL2Q9UBD3 114 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0J9YX75 114 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BQ15 152 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ISLRO14498 428 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 MPC2O95563 127 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SCGB1D1O95968 90 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF7P21781 194 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMLGP49069 296 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMB3P49720 205 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFA1P59665 94 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFA3P59666 94 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 RAP2BP61225 183 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOTP62341 195 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FGL1Q08830 312 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FCN2Q15485 313 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 Q5BKY6 102 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR73Q6P4I2 378 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 AMTNQ6UX39 209 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf92Q96LL3 132 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC1Q9HC57 220 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL17Q9UF56 701 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087X0K7 114 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAC2D3DTV9 90 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 E5RGE8 158 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC17A3O00476 420 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SPP1P10451 314 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 S100A11P31949 105 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ID1P41134 155 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 GALR1P47211 349 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 BAXQ07812 192 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 CLINT1Q14677 625 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM78BQ5VT40 261 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF546Q86UE3 836 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP6Q8TBB0 222 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF141Q8WVD5 230 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 CELA1Q9UNI1 258 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 LCE6AA0A183 80 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SSNA1O43805 119 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 COX7A2P2O60397 106 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 RLN2P04090 185 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLC2P0DOY2 106 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 B2MP61769 119 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR3DS1Q14943 382 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PSG3Q16557 428 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1FQ16864 119 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 MBD2Q9UBB5 411 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPB11Q9Y547 144 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 G3V3Q6 166 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R2Z0 102 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFB4O95168 129 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PTTG1O95997 202 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PYYP10082 97 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 MEOX2P50222 304 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PSG9Q00887 426 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGEF1-206ENST00000461017 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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