RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H3BTX0 84 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GOSR2O14653 212 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SIX6O95475 246 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MZT2BQ6NZ67 158 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAP18Q8IXM2 172 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RFNGQ9Y644 331 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC17A3O00476 420 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OPCMLQ14982 345 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VWC2Q2TAL6 325 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DKK2Q9UBU2 259 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM9A6NGZ8 99 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COX7A2P2O60397 106 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100A7P31151 101 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PSG3Q16557 428 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM222AQ5U5X8 452 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AMBPP02760 352 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CAMLGP49069 296 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TCTAP57738 103 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNF126Q9BV68 326 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UQCC1Q9NVA1 299 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H3BQ15 152 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SULT1A1P50225 295 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ENKURQ8TC29 256 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRAC2D3DTV9 90 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HBE1P02100 147 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPART-AS1P0CW21 52 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLC2P0DOY2 106 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NACAE9PAV3 2078 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM189A5PLL7 270 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H0YIZ8 118 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 INSP01308 110 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAXQ07812 192 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIR3DS1Q14943 382 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RRN3P1Q2M238 152 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CXCL2P19875 107 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AZU1P20160 251 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FGF7P21781 194 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LCN15Q6UWW0 184 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRRC20Q8TCA0 184 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 B2MP61769 119 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RHOBP62745 196 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NHLH2Q02577 135 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GCSAMLQ5JQS6 135 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM208Q9BTX3 173 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HTN3P15516 51 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100A11P31949 105 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100A7AQ86SG5 101 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 STX12Q86Y82 276 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC50A1Q9BRV3 221 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF586Q9NXT0 402 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAH2Q9P225 4427 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H2BFSP57053 126 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 THAP6Q8TBB0 222 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHAC2Q8WUX2 184 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HBG1P69891 147 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HBG2P69892 147 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAB31Q13636 194 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FCN2Q15485 313 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZRG5 221 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms