RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 LEMD1Q68G75 181 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 TEX261Q6UWH6 196 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 CSTL1Q9H114 145 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 HELTA6NFD8 242 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 IFNA7P01567 189 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 DEFB131AP59861 70 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 SELENOTP62341 195 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PRR20EP86478 221 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PRR20CP86479 221 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PRR20DP86480 221 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PRR20BP86481 221 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PRR20AP86496 221 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 DOK5Q9P104 306 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 ZNF688P0C7X2 276 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 ORM2P19652 201 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 RAB2AP61019 212 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 SERF2P84101 59 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZRG5 221 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 RYR1P21817 5038 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 COX7A2P2O60397 106 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 OR5G3P0C626 314 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 SULT1A2P50226 295 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 OR11H2Q8NH07 326 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 GLMPQ8WWB7 406 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A22Q9H936 323 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 U3KQE9 123 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 UMAD1C9J7I0 102 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 K7EQG2 157 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 BUB3O43684 328 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 MBP02144 154 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 M6PRP20645 277 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PSMG4Q5JS54 123 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 STHQ8IWL8 128 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 HRH4Q9H3N8 390 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 RPRMQ9NS64 109 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPV4 95 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 KNCNA6PVL3 124 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 HYPMO75409 117 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 MED14OSP0DP75 135 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 FHITP49789 147 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 RAB5CP51148 216 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 PLP1P60201 277 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 DCANP1Q8TF63 244 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 RNF141Q8WVD5 230 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 UHRF2Q96PU4 802 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 PFDN5Q99471 154 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 NRN1Q9NPD7 142 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 IGLL5B9A064 214 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 RHOBP62745 196 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 FAM78BQ5VT40 261 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 PATE2Q6UY27 113 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GV50 99 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 RGS13O14921 159 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 S100A7P31151 101 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 RAB14P61106 215 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 ZNF726P1Q15940 193 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-210ENST00000442481 MORN5Q5VZ52 161 aa8.5□□□□□ -1.05
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