RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	RRN3P1	Q2M238	152 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	MGST2	Q99735	147 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF24	Q9Y225	148 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R2Z0	102 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	GOSR2	O14653	212 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF846	Q147U1	533 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM210B	Q96KR6	192 aa		12.6	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738		L7N2F9	121 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	INS	P01308	110 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738		P0DMU3	169 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM231A	P0DMU4	169 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM231C	P0DMU5	169 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCL2	P19875	107 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	VAMP2	P63027	116 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	IL15RA	Q13261	267 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	PSG3	Q16557	428 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM25E	A8MYX2	175 aa		12.58	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	RTL8C	O15255	209 aa		12.58	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	C2orf50	Q96LR7	162 aa		12.58	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	C5orf51	A6NDU8	294 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPO	P30536	169 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	B2M	P61769	119 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	VWC2	Q2TAL6	325 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	MORN5	Q5VZ52	161 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12.57	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	CST7	O76096	145 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	PRM2	P04554	102 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	BCAP31	P51572	246 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	CAV2	P51636	162 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R2N4	97 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	COX7A2P2	O60397	106 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLC2	P0DOY2	106 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMLG	P49069	296 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	OPCML	Q14982	345 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	LYRM9	A8MSI8	78 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	SULT1A1	P50225	295 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	DAD1	P61803	113 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	RHOB	P62745	196 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	ASAH1	Q13510	395 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB32	Q13637	225 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	MIC13	Q5XKP0	118 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	BATF3	Q9NR55	127 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		12.54	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC17A3	O00476	420 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	CDKN1B	P46527	198 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB31	Q13636	194 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZRG5	221 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	S100Z	Q8WXG8	99 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	NACA	E9PAV3	2078 aa		12.52	□□□□□ -0.4
MRPL28-203	ENST00000429738	IGSF23	A1L1A6	192 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BQ15	152 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	AZU1	P20160	251 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A11	P31949	105 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A10	P60903	97 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		12.52	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	HTN3	P15516	51 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R60	P59551	318 aa		12.51	□□□□□ -0.41

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