RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 M0R2N4 97 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 PATE2Q6UY27 113 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF546Q86UE3 836 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 BAP18Q8IXM2 172 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ARL6Q9H0F7 186 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ARV1Q9H2C2 271 aa14.83□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 PSG3Q16557 428 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.82□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SCGB1D2O95969 90 aa14.81□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 IL7P13232 177 aa14.81□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.81□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 LCN15Q6UWW0 184 aa14.81□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.8□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.8□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 NACAE9PAV3 2078 aa14.8□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf66A4D0T2 115 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 GOSR2O14653 212 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 AGPAT2O15120 278 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R60P59551 318 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 PRM2P04554 102 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 MED14OSP0DP75 135 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 CDKN1BP46527 198 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 RHOBP62745 196 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ARL16Q0P5N6 197 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf74Q96GX8 76 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-208ENST00000428064 AZU1P20160 251 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB130BP0DP73 79 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB130AP0DP74 79 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01587Q99440 93 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 MGST2Q99735 147 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CBY3A6NI87 242 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 COX7A2P2O60397 106 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5G1P05496 136 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5G3P48201 142 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 H7BYZ3 331 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G10O15496 165 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 IGLC2P0DOY2 106 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF846Q147U1 533 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 L7N2F9 121 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 LYRM1O43325 122 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 VAMP2P63027 116 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RAB31Q13636 194 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ATG101Q9BSB4 218 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 F5H768 121 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CCSO14618 274 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TCRBP04435 133 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CAMLGP49069 296 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 OPCMLQ14982 345 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 FCN2Q15485 313 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 GUK1Q16774 197 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 MORN5Q5VZ52 161 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLC17A3O00476 420 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 VWC2Q2TAL6 325 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZRG5 221 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ODF3Q96PU9 254 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-208ENST00000428064 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 PFDN5Q99471 154 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF253O75346 499 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 HTN1P15515 57 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 BCAP31P51572 246 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 CAV2P51636 162 aa14.69□□□□□ -0.06
LIMS1-208ENST00000428064 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.69□□□□□ -0.06
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