RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 CSN1S1P47710 185 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SELENOTP62341 195 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 C2orf83Q53S99 150 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TMEM189A5PLL7 270 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 CCL21O00585 134 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 GPR183P32249 361 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 EMP1P54849 157 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 Q0VG73 95 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 TMEM160Q9NX00 188 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX13-201ENST00000409076 JMJD1CQ15652 2540 aa6.65□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 GAGE10A6NGK3 116 aa6.65□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 K7EQM0 130 aa6.65□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 GUSBP1Q15486 140 aa6.65□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.65□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 K7ERJ3 54 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 COX11Q9Y6N1 276 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 A0A1B0GUT8 65 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 HLA-DRB1P01911 266 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 GAGE1Q13065 139 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 TMEM219Q86XT9 240 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 PSG8Q9UQ74 426 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 Q8N976 141 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 PRELID3AQ96N28 172 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 TMEM178BH3BS89 294 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGLV1-44P01699 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGHV3-11P01762 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 MGPP08493 103 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 LY6EQ16553 131 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 C11orf52Q96A22 123 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGHG3P01860 377 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 CD3EP07766 207 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 RBX1P62877 108 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 E7EQL1 145 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 PCP2Q8IVA1 136 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 LRRK2Q5S007 2527 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 J3QW42 95 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 M0R381 172 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 GAS8-AS1O95177 125 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 PSG9Q00887 426 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 RIGQ13278 110 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 UBE2V1Q13404 147 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 MTORP42345 2549 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 H7C2G1 150 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 NDUFA3O95167 84 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 Q5PR19 223 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 Q86TA4 180 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 RNF125Q96EQ8 232 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 FOXC2Q99958 501 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 DKK2Q9UBU2 259 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 TM4SF5O14894 197 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 FCN3O75636 299 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 TMPRSS3P57727 454 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 Q6ZQT7 251 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 MBD6Q96DN6 1003 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 AGRNO00468 2067 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 VGLL1Q99990 258 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 NGBQ9NPG2 151 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 FAM231BA6NCW3 169 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.61□□□□□ -1.35
SNX13-201ENST00000409076 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.6 ms