RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 H3BTX0 84 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A3O00476 420 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 FAM78BQ5VT40 261 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 CLUHP3Q96NS8 147 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 RPRMQ9NS64 109 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 ZNF586Q9NXT0 402 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 CSMD3Q7Z407 3707 aa16.24■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 CXCL2P19875 107 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 MIR17HGQ75NE6 70 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 SCGB1C1Q8TD33 95 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A2Q9BXI2 301 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.23■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 SMLR1H3BR10 107 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 PSG3Q16557 428 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 LCN15Q6UWW0 184 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 KCNIP2Q9NS61 270 aa16.22■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 IGKV3-20P01619 116 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 FFAR4Q5NUL3 377 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 CLEC5AQ9NY25 188 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 STARD9Q9P2P6 4700 aa16.21■□□□□ 0.19
SYF2-201ENST00000236273 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 PYYP10082 97 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 TMEM41BQ5BJD5 291 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 EBLN2Q6P2I7 272 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 AMTNQ6UX39 209 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 MUC7Q8TAX7 377 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 RARRES2Q99969 163 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 FUT9Q9Y231 359 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB4O95168 129 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZNX1 250 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 OR4B1Q8NGF8 309 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 OR11H2Q8NH07 326 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 LRRC20Q8TCA0 184 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF503Q96F45 646 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 SLC50A1Q9BRV3 221 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 SLC35B3Q9H1N7 401 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 TIMM9Q9Y5J7 89 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 TRBV19A0A075B6N1 114 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 A0A0J9YWU9 116 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 FXYD7P58549 80 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 GUK1Q16774 197 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF738Q8NE65 137 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 OR11H4Q8NGC9 324 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 XCL2Q9UBD3 114 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF253O75346 499 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 CNN1P51911 297 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 PSG9Q00887 426 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ZNF266Q14584 549 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 X6R8D5 127 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 PRAC2D3DTV9 90 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V0CP27449 155 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 OR8A1Q8NGG7 326 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 C3orf84H3BNL1 204 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 OR2G3Q8NGZ4 309 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 FXYD5Q96DB9 178 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 OR51M1Q9H341 326 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 ARPC5O15511 151 aa16.15■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 M6PRP20645 277 aa16.15■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 RAB2AP61019 212 aa16.15■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa16.15■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 MFFQ9GZY8 342 aa16.15■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 CYTL1Q9NRR1 136 aa16.15■□□□□ 0.18
SYF2-201ENST00000236273 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 RHOBP62745 196 aa16.14■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 PDE6HQ13956 83 aa16.14■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 CASC10Q5T4H9 136 aa16.14■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 Q8NAQ8 132 aa16.14■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 ST6GAL2Q96JF0 529 aa16.14■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 PAXXQ9BUH6 204 aa16.14■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16.14■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 CRXO43186 299 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 NBEAP1P0C6P0 100 aa16.13■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 BLNKQ8WV28 456 aa16.13■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 RNF141Q8WVD5 230 aa16.13■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 M0R3E3 92 aa16.12■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 OR10J4P0C629 311 aa16.12■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 RBMY1CP0DJD4 496 aa16.12■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.12■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms