RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.92□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.92□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 SUN5Q8TC36 379 aa5.92□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 TMED6Q8WW62 240 aa5.92□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 RNF125Q96EQ8 232 aa5.92□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 PFDN5Q99471 154 aa5.92□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 HELTA6NFD8 242 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 C2orf70A6NJV1 201 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 TEX46H3BTG2 121 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 HYPMO75409 117 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 IL4P05112 153 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 PSG1P11464 419 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 FOLR2P14207 255 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 FGF7P21781 194 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 LYZP61626 148 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 BLOC1S1P78537 153 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 CLINT1Q14677 625 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 MLANAQ16655 118 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 BTNL8Q6UX41 500 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 GPR82Q96P67 336 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 PRR25Q96S07 402 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.91□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM213A2RRL7 107 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 UMAD1C9J7I0 102 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 AGPAT2O15120 278 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 COX7A2P2O60397 106 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00869P0C866 280 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 SPP1P10451 314 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 CBLN1P23435 193 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 MEOX2P50222 304 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 NHLH2Q02577 135 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf194Q5T5A4 169 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 STPG3Q8N7X2 389 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 RNF2Q99496 336 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF548-208ENST00000597576 OR4C46A6NHA9 309 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 MBP02144 154 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 CSN3P07498 182 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 OR5G3P0C626 314 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 C8orf88P0DMB2 117 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 ORM2P19652 201 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 CRYBB3P26998 211 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 GALR1P47211 349 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 PLP1P60201 277 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 B2MP61769 119 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF90Q03938 601 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 ARL16Q0P5N6 197 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 TM4SF20Q53R12 229 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 SMPXQ9UHP9 88 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 CHEK1O14757 476 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV1-51P01701 117 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 MGST2Q99735 147 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.87□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.87□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.87□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 TSPAN4O14817 238 aa5.87□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
ZNF548-208ENST00000597576 TAS2R45P59539 299 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.5 ms