RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 RAP2BP61225 183 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 PAFAH1B2P68402 229 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 OPCMLQ14982 345 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF124Q15973 351 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 DEFB135Q30KP9 77 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 Q5BKY6 102 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 TEPPQ6URK8 271 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 PATE2Q6UY27 113 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZNX1 250 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 TCF24Q7RTU0 167 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF183Q96D59 192 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 AQP10Q96PS8 301 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 MED28Q9H204 178 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 MBD2Q9UBB5 411 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 HSPB11Q9Y547 144 aa5.05□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A0J9YWU9 116 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 A8MTW9 85 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 H3BRN7 92 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 L7N2F9 121 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 AGPAT2O15120 278 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 CAV2P51636 162 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 S100A10P60903 97 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 VAMP2P63027 116 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 HBG1P69891 147 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 HBG2P69892 147 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 NHLH2Q02577 135 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 AKR1C1Q04828 323 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF546Q86UE3 836 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 STX12Q86Y82 276 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 RABAC1Q9UI14 185 aa5.04□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A087X0K7 114 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF222A6NCQ9 220 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 HELTA6NFD8 242 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF98A6NK75 572 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 JTBO76095 146 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 RLN2P04090 185 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 CFAP161Q6P656 301 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 CSTL1Q9H114 145 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 WFDC1Q9HC57 220 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXL17Q9UF56 701 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.03□□□□□ -1.6
EFTUD2-210ENST00000588340 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 CAMLGP49069 296 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 DEFB131AP59861 70 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 LYZP61626 148 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 FGL1Q08830 312 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 OR2F1Q13607 317 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 LEMD1Q68G75 181 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR82Q96P67 336 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP5SQ99766 215 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 NRN1Q9NPD7 142 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 CXorf65A6NEN9 183 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 HYPMO75409 117 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 OR5G3P0C626 314 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLC2P0DOY2 106 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 BCAP31P51572 246 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 PMS2P11Q13670 270 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 MORN5Q5VZ52 161 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 MIC13Q5XKP0 118 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.01□□□□□ -1.61
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms