RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564311.5

RNPS1-209, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 5

Gene RNPS1, Length 870 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-209	ENST00000564311	TEPP	Q6URK8	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	GPR82	Q96P67	336 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	MFF	Q9GZY8	342 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	XCL2	Q9UBD3	114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311		F6UB75	175 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	LYST	Q99698	3801 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	HRH4	Q9H3N8	390 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311		A0A0J9YX75	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	AGPAT2	O15120	278 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	OR5G3	P0C626	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ZNF546	Q86UE3	836 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ENKUR	Q8TC29	256 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	UHRF2	Q96PU4	802 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	MGST2	Q99735	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311		A8MTW9	85 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	CST7	O76096	145 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	BCAP31	P51572	246 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	CAV2	P51636	162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	FXYD7	P58549	80 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	RAB32	Q13637	225 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311		A0A087X0K7	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	GOSR2	O14653	212 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	VWC2	Q2TAL6	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	S100A10	P60903	97 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	PSG9	Q00887	426 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	NEU1	Q99519	415 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RNPS1-209	ENST00000564311	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	SULT1A1	P50225	295 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	PRR20E	P86478	221 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	PRR20C	P86479	221 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	PRR20D	P86480	221 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	PRR20B	P86481	221 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	PRR20A	P86496	221 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	FGL1	Q08830	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	S100A7A	Q86SG5	101 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	PRAF2	O60831	178 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	SIX6	O95475	246 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	LY6G6C	O95867	125 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	CXCL3	P19876	107 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	S100A11	P31949	105 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	CAMLG	P49069	296 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	BATF3	Q9NR55	127 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	RNF24	Q9Y225	148 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	C11orf94	C9JXX5	98 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	COX7A2P2	O60397	106 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	RAB31	Q13636	194 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	OPCML	Q14982	345 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311		Q6ZTC4	211 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	STX12	Q86Y82	276 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RNPS1-209	ENST00000564311	NMES1	Q9C002	83 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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