RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-208ENST00000558285 ARL3P36405 182 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 PRR13Q9NZ81 148 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 GPR132Q9UNW8 380 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 NSG2Q9Y328 171 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.67□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 DEDDO75618 318 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 PRH1P02810 166 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 MYOD1P15172 320 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 SYNJ2BPP57105 145 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 RAB32Q13637 225 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 CFAP161Q6P656 301 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 GPHA2Q96T91 129 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 LGALS9O00182 355 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 AREGP15514 252 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 AKR1C4P17516 323 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 ATP6V1FQ16864 119 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 GPHB5Q86YW7 130 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 B9D2Q9BPU9 175 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-208ENST00000558285 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 A0A1B0GU03 582 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 ZNF320A2RRD8 509 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 K7EIL1 84 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 GP9P14770 177 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 KRTAP10-11P60412 298 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 PRCDQ00LT1 54 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 ZNF266Q14584 549 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 KLK9Q2XQG4 91 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 ZNF585BQ52M93 769 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP3-208ENST00000558285 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 IL22RA2Q969J5 263 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 TXN2Q99757 166 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 NAA60Q9H7X0 242 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 XKRY2A2RUG3 117 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 TOMM40O96008 361 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 IFNA21P01568 189 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 IGLV1-51P01701 117 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 UCP1P25874 307 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 S100A10P60903 97 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 Q56UQ5 140 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP3-208ENST00000558285 NAGKQ9UJ70 344 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP3-208ENST00000558285 REG1AP05451 166 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 CLEC3BP05452 202 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 MFAP4P55083 255 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 OR5I1Q13606 314 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 ZNF114Q8NC26 417 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 SLC35E1Q96K37 410 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 PRR25Q96S07 402 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 ZMAT4Q9H898 229 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-208ENST00000558285 BMPR1BO00238 502 aa6.62□□□□□ -1.35
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