RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.15□□□□□ -0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.15□□□□□ -0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.14□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEMD1Q68G75 181 aa14.14□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.14□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCANP1Q8TF63 244 aa14.14□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF24Q9Y225 148 aa14.14□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEFB4AO15263 64 aa14.13□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ORM2P19652 201 aa14.13□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ID1P41134 155 aa14.13□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GALR1P47211 349 aa14.13□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB31Q13636 194 aa14.13□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEPPQ6URK8 271 aa14.13□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.13□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 S100A11P31949 105 aa14.12□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAP2BP61225 183 aa14.12□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMG4Q5JS54 123 aa14.12□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF546Q86UE3 836 aa14.12□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STX12Q86Y82 276 aa14.12□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASB13Q8WXK3 278 aa14.12□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR82Q96P67 336 aa14.12□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HRH4Q9H3N8 390 aa14.12□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf94C9JXX5 98 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HYPMO75409 117 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PET100P0DJ07 73 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MEOX2P50222 304 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HBG1P69891 147 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HBG2P69892 147 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR20EP86478 221 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR20CP86479 221 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR20DP86480 221 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR20BP86481 221 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR20AP86496 221 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NHLH2Q02577 135 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.11□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00869P0C866 280 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPP1P10451 314 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLP1P60201 277 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAXQ07812 192 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6V1FQ16864 119 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q8NAQ8 132 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A22Q9H936 323 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBD2Q9UBB5 411 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.1□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLL5B9A064 214 aa14.09□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.09□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MGST2Q99735 147 aa14.09□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.09□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APLNQ9ULZ1 77 aa14.09□□□□□ -0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF98A6NK75 572 aa14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGPAT2O15120 278 aa14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR5G3P0C626 314 aa14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMB3P49720 205 aa14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q5BKY6 102 aa14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DOK5Q9P104 306 aa14.08□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 G3V3Q6 166 aa14.07□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.07□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIFP14174 115 aa14.07□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00052Q96N35 136 aa14.07□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.06□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KNCNA6PVL3 124 aa14.06□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ISLRO14498 428 aa14.06□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARL6Q9H0F7 186 aa14.06□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSPB11Q9Y547 144 aa14.06□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLA-DMBP28068 263 aa14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C16orf92Q96LL3 132 aa14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSG1Q9BU20 258 aa14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.05□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAH2Q9P225 4427 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 H3BRN7 92 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COX7A2P2O60397 106 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MPDU1O75352 247 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMLGP49069 296 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGL1Q08830 312 aa14.04□□□□□ -0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OPCMLQ14982 345 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms