RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 C3orf56Q8N813 242 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 GJC3Q8NFK1 279 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 TVP23CQ96ET8 276 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 AGMATQ9BSE5 352 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FAM231BA6NCW3 169 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 IGLC6P0CF74 106 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 COX5AP20674 150 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FRG2Q64ET8 278 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 LCN15Q6UWW0 184 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 MAL2Q969L2 176 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 C9orf85Q96MD7 179 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FRG2BQ96QU4 278 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 OR4F4Q96R69 305 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 GABARAPH6UMI1 98 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 PMS2P2O95744 297 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 GYPAP02724 150 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 LINC00869P0C866 280 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FABP2P12104 132 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A6P12236 298 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 GPR183P32249 361 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZVH6 145 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 RARRES2Q99969 163 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 JPT2Q9H910 190 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 NSG2Q9Y328 171 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 C17orf100A8MU93 164 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 GNGT2O14610 69 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 HLA-DQA2P01906 255 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FAM236CP0DP71 79 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 IGHV1-2P23083 117 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 EDNRAP25101 427 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 SPHARQ15513 63 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FAM57BQ71RH2 274 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 LINC01587Q99440 93 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PPK0 400 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 NDUFB4O95168 129 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 SFTPDP35247 375 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 PMAIP1Q13794 54 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 KIAA0040Q15053 153 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 AMTNQ6UX39 209 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 C10orf111Q8N326 155 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 PIFOQ8TCI5 191 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FZR1Q9UM11 496 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-212ENST00000535535 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115 ms