RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	NHLH2	Q02577	135 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059		Q6ZWC4	215 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	RSG1	Q9BU20	258 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.22	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059		H0YIZ8	118 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	SPRY2	O43597	315 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	FCN2	Q15485	313 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	MIC13	Q5XKP0	118 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	PFDN5	Q99471	154 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CHID1-222	ENST00000533059	COL7A1	Q02388	2944 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	ISLR	O14498	428 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	SPP1	P10451	314 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	CXCL3	P19876	107 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	IFNA5	P01569	189 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	OPCML	Q14982	345 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	ATP5S	Q99766	215 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	PRR20E	P86478	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	PRR20C	P86479	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	PRR20D	P86480	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	PRR20B	P86481	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	PRR20A	P86496	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	PATE2	Q6UY27	113 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	MUC7	Q8TAX7	377 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	SOCS3	O14543	225 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	OXA1L	Q15070	435 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	RNF183	Q96D59	192 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059		A0A087X0K7	114 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	C3orf84	H3BNL1	204 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	RARRES2	Q99969	163 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059		H3BMM0	161 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	LYL1	P12980	280 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	CXCL2	P19875	107 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	IL17D	Q8TAD2	202 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CHID1-222	ENST00000533059	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	C4BPB	P20851	252 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	FAM78B	Q5VT40	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059		A0A0J9YWU9	116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059		F6UB75	175 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	DEFB1	P60022	68 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF266	Q14584	549 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CHID1-222	ENST00000533059	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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