RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531244.1

PPP6R3-222, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 5

Gene PPP6R3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-222	ENST00000531244	PDPN	Q86YL7	162 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MED12L	Q86YW9	2145 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PNKD	Q8N490	385 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR5B3	Q8NH48	314 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR4A5	Q8NH83	315 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RAB1C	Q92928	201 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SFRP2	Q96HF1	295 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PAXX	Q9BUH6	204 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	DERL1	Q9BUN8	251 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	BET1L	Q9NYM9	111 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		2.55	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PTPRB	P23467	1997 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244		H3BTX0	84 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244		K7ENP7	123 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SLC17A3	O00476	420 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	FCN1	O00602	326 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PHOX2A	O14813	284 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	IGHV2-5	P01817	119 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SOD3	P08294	240 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	STAG3L2	P0CL84	134 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	STAG3L3	P0CL85	134 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	C8orf88	P0DMB2	117 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	GP9	P14770	177 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PMCH	P20382	165 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CBLN1	P23435	193 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CEACAM3	P40198	252 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PPOX	P50336	477 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	DLX1	P56177	255 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TPPP2	P59282	170 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SLC35B1	P78383	322 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	PAX5	Q02548	391 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	KLRB1	Q12918	225 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR5I1	Q13606	314 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	SSX2	Q16385	188 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	C2orf83	Q53S99	150 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244		Q56UQ5	140 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TCF23	Q7RTU1	214 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	LINC01551	Q86U37	167 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	MUC15	Q8N387	334 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF596	Q8TC21	504 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	VCX2	Q9H322	139 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	OR51M1	Q9H341	326 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	FBXL15	Q9H469	300 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	GNB4	Q9HAV0	340 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	IL36B	Q9NZH7	164 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP6R3-222	ENST00000531244	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		2.54	□□□□□ -2

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