RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PIP4P1	Q86T03	277 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX45	Q8NA69	505 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM186	Q96B77	213 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	GUCD1	Q96NT3	240 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF747	Q9BV97	191 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		Q9H3A6	140 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ZMAT4	Q9H898	229 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A096LNJ9	63 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GUT8	65 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM178B	H3BS89	294 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A17	O43808	307 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV1-17	P01599	117 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLC1	P0CG04	106 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ORM2	P19652	201 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MC5R	P33032	325 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PSG9	Q00887	426 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PAX8	Q06710	450 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	VAMP3	Q15836	100 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RPRML	Q8N4K4	120 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	BLNK	Q8WV28	456 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SGK494	Q96LW2	274 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DSCAM	O60469	2012 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087X0K7	114 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	C17orf100	A8MU93	164 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BTX0	84 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		I3L2K1	104 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		M0R296	226 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CHEK1	O14757	476 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NCR2	O95944	276 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PSG1	P11464	419 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR183	P32249	361 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CRIP1	P50238	77 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF138	P52744	262 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ARF6	P62330	175 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC11A	P67812	179 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RBPJ	Q06330	500 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RIG	Q13278	110 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	COTL1	Q14019	142 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ADIPOQ	Q15848	244 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	HCP5	Q6MZN7	132 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CST9L	Q9H4G1	147 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01546	A6NGU7	62 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CBY3	A6NI87	242 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIAL4D	F5H284	164 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BRN7	92 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFB3	O43676	98 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TOX4	O94842	621 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV1-47	P01700	117 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.91	□□□□□ -1.78

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