RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 IFNA7P01567 189 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CRYBB3P26998 211 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RHOBP62745 196 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.57□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RAB2AP61019 212 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TM4SF20Q53R12 229 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 FAM78BQ5VT40 261 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TEX261Q6UWH6 196 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 PATE2Q6UY27 113 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RPRMQ9NS64 109 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 SMPXQ9UHP9 88 aa8.56□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM213A2RRL7 107 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 C2orf70A6NJV1 201 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF98A6NK75 572 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 H3BRN7 92 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CD5P06127 495 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CBLN1P23435 193 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 SULT1A2P50226 295 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TAS2R45P59539 299 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RNF141Q8WVD5 230 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 GPR82Q96P67 336 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 UHRF2Q96PU4 802 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 VSIRQ9H7M9 311 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 FUT9Q9Y231 359 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 U3KQE9 123 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RYR3Q15413 4870 aa8.55□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 BUB3O43684 328 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV1-51P01701 117 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 C8orf88P0DMB2 117 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 FOLR2P14207 255 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A22Q9H936 323 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.54□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 HELTA6NFD8 242 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TEX46H3BTG2 121 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CHEK1O14757 476 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CSN3P07498 182 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 BLOC1S1P78537 153 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 KHDC3LQ587J8 217 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 Q8N1Y9 231 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 RAB24Q969Q5 203 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CITED4Q96RK1 184 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 GALR1P47211 349 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 LCE6AA0A183 80 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 OR7C2O60412 319 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 CXorf1O96002 111 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 STAG3L2P0CL84 134 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.1 ms