RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	OR5G3	P0C626	314 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF688	P0C7X2	276 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	CXCL3	P19876	107 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	GALR1	P47211	349 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	CAMLG	P49069	296 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	OXA1L	Q15070	435 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF124	Q15973	351 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	RNF183	Q96D59	192 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	ARL6	Q9H0F7	186 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	NUPR2	A6NF83	97 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	NHLH2	Q02577	135 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	FCN2	Q15485	313 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	LEMD1	Q68G75	181 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	ASB13	Q8WXK3	278 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	MBD2	Q9UBB5	411 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	FGF7	P21781	194 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	MEOX2	P50222	304 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	RNF126	Q9BV68	326 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	ARV1	Q9H2C2	271 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	AGRN	O00468	2067 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2C	O00762	179 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	COX7A2P2	O60397	106 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	PSMB3	P49720	205 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	OPCML	Q14982	345 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZRG5	221 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	STH	Q8IWL8	128 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	THAP6	Q8TBB0	222 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	UHRF2	Q96PU4	802 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	HSPB11	Q9Y547	144 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	HERC2	O95714	4834 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	ID1	P41134	155 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	PRR20E	P86478	221 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	PRR20C	P86479	221 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	PRR20D	P86480	221 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	PRR20B	P86481	221 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	PRR20A	P86496	221 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	CLINT1	Q14677	625 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	PFDN5	Q99471	154 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MIB2-223	ENST00000508148	SOCS3	O14543	225 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	B2M	P61769	119 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	FGL1	Q08830	312 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	MIC13	Q5XKP0	118 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	PATE2	Q6UY27	113 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	ATP5S	Q99766	215 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	ISLR	O14498	428 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	RSG1	Q9BU20	258 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	C16orf92	Q96LL3	132 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	CSTL1	Q9H114	145 aa		12.12	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148		A0A087X0K7	114 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	KNCN	A6PVL3	124 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	SPP1	P10451	314 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF709	Q8N972	641 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00052	Q96N35	136 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	IFNA5	P01569	189 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MIB2-223	ENST00000508148	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		12.1	□□□□□ -0.47

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