RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493957.5

UBA3-211, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, humanhuman

TSL 3

Gene UBA3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3-211ENST00000493957 PLP1P60201 277 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 SELENOTP62341 195 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 HBG1P69891 147 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 HBG2P69892 147 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 BAXQ07812 192 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 CLINT1Q14677 625 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 Q5BKY6 102 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 MORN5Q5VZ52 161 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 ZNF546Q86UE3 836 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 THAP6Q8TBB0 222 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 NRN1Q9NPD7 142 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.59□□□□□ -1.03
UBA3-211ENST00000493957 SOCS3O14543 225 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 CAMLGP49069 296 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 OPCMLQ14982 345 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 PSMG4Q5JS54 123 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 SPATA25Q9BR10 227 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 ARV1Q9H2C2 271 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 ZMAT4Q9H898 229 aa8.58□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 LYL1P12980 280 aa8.57□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 RAP2BP61225 183 aa8.57□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.57□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 C20orf173Q96LM9 149 aa8.57□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.57□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 FBXL17Q9UF56 701 aa8.57□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 HSPB11Q9Y547 144 aa8.57□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 COX7A2P2O60397 106 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 PET100P0DJ07 73 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 ATP6V1FQ16864 119 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 DEFB135Q30KP9 77 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 RSG1Q9BU20 258 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 WFDC1Q9HC57 220 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 RFNGQ9Y644 331 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.56□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 C4BPBP20851 252 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 GALR1P47211 349 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 APOC4P55056 127 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 B2MP61769 119 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 LINC00052Q96N35 136 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.55□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 F6UB75 175 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 G3V3Q6 166 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 H3BTX0 84 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 HLA-DMBP28068 263 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 FGL1Q08830 312 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 RAB31Q13636 194 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 STHQ8IWL8 128 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 RNF182Q8N6D2 247 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 ATP5SQ99766 215 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.54□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 PSMB3P49720 205 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 C16orf92Q96LL3 132 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 GPR82Q96P67 336 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 CSTL1Q9H114 145 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.53□□□□□ -1.04
UBA3-211ENST00000493957 A0A087X0K7 114 aa8.52□□□□□ -1.05
UBA3-211ENST00000493957 H3BMM0 161 aa8.52□□□□□ -1.05
UBA3-211ENST00000493957 SMLR1H3BR10 107 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms