RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493552.1

CTBP2-210, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 5

Gene CTBP2, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-210	ENST00000493552	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	C16orf74	Q96GX8	76 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	PRR13	Q9NZ81	148 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RNF24	Q9Y225	148 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		2.55	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552		A0A1W2PPQ1	181 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	EPM2A	B3EWF7	344 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	WRB	O00258	174 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	CTDSP2	O14595	271 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	EREG	O14944	169 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	CTDSPL	O15194	276 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SYNGR2	O43760	224 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	PITX3	O75364	302 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	HYPM	O75409	117 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	IL5	P05113	134 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	IAPP	P10997	89 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SLC25A6	P12236	298 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	M6PR	P20645	277 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RAP2B	P61225	183 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	AKR1C1	Q04828	323 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	IL18	Q14116	193 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	PSG3	Q16557	428 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	CTF1	Q16619	201 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	BAP18	Q8IXM2	172 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RNF182	Q8N6D2	247 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF738	Q8NE65	137 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RNF141	Q8WVD5	230 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF503	Q96F45	646 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	C17orf77	Q96MU5	243 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	UHRF2	Q96PU4	802 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552		Q9H3A6	140 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	MCUB	Q9NWR8	336 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	AGRN	O00468	2067 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552		A0A0J9YY99	117 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	GAGE12B	A1L429	117 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SMCO3	A2RU48	225 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SNURFL	B1AK76	121 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	PRSS46	E5RG02	174 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552		H3BNG1	76 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552		H3BRN7	92 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552		H7BYZ3	331 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	GAGE7	O76087	117 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RLN2	P04090	185 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	OR5G3	P0C626	314 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	GAGE12F	P0CL80	117 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	GAGE12G	P0CL81	117 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	GAGE12I	P0CL82	117 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	CXCL3	P19876	107 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	VAMP1	P23763	118 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	CDKN1B	P46527	198 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	KRTAP10-2	P60368	255 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SELENOT	P62341	195 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	DLK1	P80370	383 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	ESRG	Q1W209	222 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	LRTM2	Q8N967	370 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CTBP2-210	ENST00000493552	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms