RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490667.1

SHC1-211, Transcript of SHC adaptor protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SHC1, Length 727 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1-211ENST00000490667 XCL2Q9UBD3 114 aa9.56□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 AGPAT2O15120 278 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 CST7O76096 145 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 MIFP14174 115 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 S100A10P60903 97 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 RAB32Q13637 225 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 PATE2Q6UY27 113 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 Q8NAQ8 132 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 C20orf173Q96LM9 149 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 MFFQ9GZY8 342 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 RPRMQ9NS64 109 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 X6R8D5 127 aa9.55□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 F6UB75 175 aa9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 FGL1Q08830 312 aa9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 ZNF546Q86UE3 836 aa9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 UHRF2Q96PU4 802 aa9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 MGST2Q99735 147 aa9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 ARV1Q9H2C2 271 aa9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 A0A0J9YX75 114 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 PRAF2O60831 178 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 SIX6O95475 246 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 S100A11P31949 105 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 SULT1A1P50225 295 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 FXYD7P58549 80 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 PSG9Q00887 426 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 RAB31Q13636 194 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 FAM78BQ5VT40 261 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 RNF24Q9Y225 148 aa9.53□□□□□ -0.88
SHC1-211ENST00000490667 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.52□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 IGSF23A1L1A6 192 aa9.52□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 RLN2P04090 185 aa9.52□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 CAMLGP49069 296 aa9.52□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 DEFA1P59665 94 aa9.52□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 DEFA3P59666 94 aa9.52□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.52□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.52□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 COX7A2P2O60397 106 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 ATP6V1FQ16864 119 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 VWC2Q2TAL6 325 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 Q6ZRG5 221 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 STX12Q86Y82 276 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 ZNF709Q8N972 641 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 HRH4Q9H3N8 390 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 RYR2Q92736 4967 aa9.51□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 A0A087X0K7 114 aa9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 HBG1P69891 147 aa9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 HBG2P69892 147 aa9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 MIC13Q5XKP0 118 aa9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 RNF182Q8N6D2 247 aa9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 NEU1Q99519 415 aa9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 NMES1Q9C002 83 aa9.5□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 LY6G6CO95867 125 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 CXCL3P19876 107 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 HLA-DMBP28068 263 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 PRR20EP86478 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 PRR20CP86479 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 PRR20DP86480 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 PRR20BP86481 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 PRR20AP86496 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 BAXQ07812 192 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 PSG3Q16557 428 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.49□□□□□ -0.89
SHC1-211ENST00000490667 ZNF738Q8NE65 137 aa9.49□□□□□ -0.89
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