RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N2B8 174 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR1P1Q8NH06 330 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ACY3Q96HD9 319 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 MFFQ9GZY8 342 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf95Q9H693 158 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC1Q9HC57 220 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RFNGQ9Y644 331 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 U3KQ87 197 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087X002 238 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PPP5D1E7EU14 171 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 I3L2K1 104 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 K7EIM0 57 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TSC22D2O75157 780 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA7O95182 113 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C1QBP02746 253 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PET100P0DJ07 73 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PSMB8P28062 276 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SULT1A1P50225 295 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RND2P52198 227 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TAS2R30P59541 319 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ATP5G2Q06055 141 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 GAMTQ14353 236 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB136Q30KP8 78 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 Q56UQ5 140 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 OR4F5Q8NH21 305 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 GNB4Q9HAV0 340 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 HSPB11Q9Y547 144 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GVY2 172 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR2T8A6NH00 312 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 HMSDA8MTL9 139 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ATP6V1G1O75348 118 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGHG4P01861 327 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 FGF7P21781 194 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GPR183P32249 361 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF90Q03938 601 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 AKR1C1Q04828 323 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR2F1Q13607 317 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TIGITQ495A1 244 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TMUB2Q71RG4 321 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 STX12Q86Y82 276 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 NECAP1Q8NC96 275 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ASB13Q8WXK3 278 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35E1Q96K37 410 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 HYLS1Q96M11 299 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 AQP10Q96PS8 301 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GON7Q9BXV9 100 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ARL6Q9H0F7 186 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 THYN1Q9P016 225 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 A0A087WW49 117 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM89A2RUT3 159 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP92A6NM28 416 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 GNG7O60262 68 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 CTSGP08311 255 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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