RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483062.5

SYN3-212, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 3

Gene SYN3, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-212ENST00000483062 C8orf88P0DMB2 117 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 NPPCP23582 126 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 CAMLGP49069 296 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 GUCA2BQ16661 112 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 ZFP69Q49AA0 526 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 BTNL8Q6UX41 500 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 METTL26Q96S19 204 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 MLXQ9UH92 298 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 S4R3C0 116 aa5.81□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 ARPC5O15511 151 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 IGKV1-17P01599 117 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 FGF7P21781 194 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 ADMP35318 185 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 CLINT1Q14677 625 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 TIGITQ495A1 244 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 RABAC1Q9UI14 185 aa5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 AGPAT2O15120 278 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 HYPMO75409 117 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 MBP02144 154 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 IL4P05112 153 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 PSG1P11464 419 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 PLP1P60201 277 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 SERF2P84101 59 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 ARL16Q0P5N6 197 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 TM4SF20Q53R12 229 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 Q5BKY6 102 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 C1orf194Q5T5A4 169 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 Q6ZWC4 215 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 RNF125Q96EQ8 232 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 PFDN5Q99471 154 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 RNF2Q99496 336 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 FBXL17Q9UF56 701 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.79□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 A0A1B0GVG6 124 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 RNF222A6NCQ9 220 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 RTL8CO15255 209 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 SPRY2O43597 315 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 LINC00869P0C866 280 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 CRYBB3P26998 211 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 B2MP61769 119 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 PAFAH1B2P68402 229 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 LCE3BQ5TA77 95 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 GPR82Q96P67 336 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 ARL6Q9H0F7 186 aa5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SYN3-212ENST00000483062 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 HELTA6NFD8 242 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 G3V3Q6 166 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 SMLR1H3BR10 107 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 TSPAN4O14817 238 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 BCL2L11O43521 198 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 COX7A2P2O60397 106 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 OR5G3P0C626 314 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 ORM2P19652 201 aa5.77□□□□□ -1.49
SYN3-212ENST00000483062 MEOX2P50222 304 aa5.77□□□□□ -1.49
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