RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 SRPXP78539 464 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A22Q9H936 323 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 MCUBQ9NWR8 336 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF98A6NK75 572 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 F5H768 121 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB11AP62491 216 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 IL18Q14116 193 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SPCS2Q15005 226 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 BAP18Q8IXM2 172 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF182Q8N6D2 247 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-210ENST00000481231 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS46E5RG02 174 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 NUDT3O95989 172 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 ANXA3P12429 323 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 ORM2P19652 201 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 AZU1P20160 251 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TSPOP30536 169 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 FCN2Q15485 313 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.58□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR141Q7Z602 305 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR82Q96P67 336 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.57□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 MED6O75586 246 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5G1P05496 136 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A6P12236 298 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5G3P48201 142 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 CCL18P55774 89 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 B2MP61769 119 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 AKR1C1Q04828 323 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 FGL1Q08830 312 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 LRTM2Q8N967 370 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF738Q8NE65 137 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF141Q8WVD5 230 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF503Q96F45 646 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 CBY3A6NI87 242 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BP45 60 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BRN7 92 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 WRBO00258 174 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SYNGR2O43760 224 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 VAMP1P23763 118 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R60P59551 318 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 DLK1P80370 383 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 HAMPP81172 84 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SSX7Q7RTT5 188 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SYT8Q8NBV8 401 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01587Q99440 93 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SOSTQ9BQB4 213 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 HTN1P15515 57 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 CXCL3P19876 107 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 S100A7P31151 101 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RHOBP62745 196 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 CLINT1Q14677 625 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZSN1 163 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.54□□□□□ -1.36
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