RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 SPP1P10451 314 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 GP9P14770 177 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 S100A7AQ86SG5 101 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 SLC25A22Q9H936 323 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 M6PRP20645 277 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 RAB2AP61019 212 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 SERF2P84101 59 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 GUCA2BQ16661 112 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 FAM78BQ5VT40 261 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 DCANP1Q8TF63 244 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 GPR82Q96P67 336 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 RNF24Q9Y225 148 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 BAP18Q8IXM2 172 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 PRR25Q96S07 402 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 NRN1Q9NPD7 142 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 FUT9Q9Y231 359 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 K7EQG2 157 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 SOCS3O14543 225 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 RPRMQ9NS64 109 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-210ENST00000477812 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 A0A087X0K7 114 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 OR4C46A6NHA9 309 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 CD7P09564 240 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 SEC11BP0C7V7 166 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 IGLC2P0DOY2 106 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 GALR1P47211 349 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 RHOBP62745 196 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 SLC51BQ86UW2 128 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 Q8N1Y9 231 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 MBP02144 154 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 TFPI2P48307 235 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 PAFAH1B2P68402 229 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 ZNF503Q96F45 646 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 FBN3Q75N90 2809 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 H3BQ15 152 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.036e-9■■■□□ 16.1
ACTB-210ENST00000477812 CD81P60033 236 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 ZNF726P1Q15940 193 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 WFDC3Q8IUB2 231 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 TMED6Q8WW62 240 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 PYYP10082 97 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 C4BPBP20851 252 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 MEOX2P50222 304 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 SSX7Q7RTT5 188 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 RAB24Q969Q5 203 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 HRH4Q9H3N8 390 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 K7EIL1 84 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 FXYD5Q96DB9 178 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PPV4 95 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 UMAD1C9J7I0 102 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 TAS2R45P59539 299 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-210ENST00000477812 KHDC3LQ587J8 217 aa14.83□□□□□ -0.04
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