RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 GPR82Q96P67 336 aa10.3□□□□□ -0.76
SRRT-210ENST00000477529 ARV1Q9H2C2 271 aa10.3□□□□□ -0.76
SRRT-210ENST00000477529 ISLRO14498 428 aa10.29□□□□□ -0.76
SRRT-210ENST00000477529 SPP1P10451 314 aa10.29□□□□□ -0.76
SRRT-210ENST00000477529 LYL1P12980 280 aa10.29□□□□□ -0.76
SRRT-210ENST00000477529 HLA-DRB4P13762 266 aa10.29□□□□□ -0.76
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SRRT-210ENST00000477529 MEOX2P50222 304 aa10.29□□□□□ -0.76
SRRT-210ENST00000477529 PRR20EP86478 221 aa10.29□□□□□ -0.76
SRRT-210ENST00000477529 PRR20CP86479 221 aa10.29□□□□□ -0.76
SRRT-210ENST00000477529 PRR20DP86480 221 aa10.29□□□□□ -0.76
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SRRT-210ENST00000477529 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.29□□□□□ -0.76
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SRRT-210ENST00000477529 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.28□□□□□ -0.76
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SRRT-210ENST00000477529 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
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SRRT-210ENST00000477529 C20orf173Q96LM9 149 aa10.28□□□□□ -0.76
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SRRT-210ENST00000477529 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
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SRRT-210ENST00000477529 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 F6UB75 175 aa10.25□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 MPDU1O75352 247 aa10.25□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 B2MP61769 119 aa10.25□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 CLINT1Q14677 625 aa10.25□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 RNF182Q8N6D2 247 aa10.25□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 RARRES2Q99969 163 aa10.25□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 ZNF709Q8N972 641 aa10.24□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 IL17DQ8TAD2 202 aa10.24□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.24□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 PFDN5Q99471 154 aa10.24□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 RNF24Q9Y225 148 aa10.24□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 NACAE9PAV3 2078 aa10.23□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 A0A0J9YX75 114 aa10.23□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 A8MTW9 85 aa10.23□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 FCN2Q15485 313 aa10.23□□□□□ -0.77
SRRT-210ENST00000477529 Q8NAQ8 132 aa10.23□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
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SRRT-210ENST00000477529 IGLC2P0DOY2 106 aa10.22□□□□□ -0.77
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