RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 VWC2Q2TAL6 325 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ARV1Q9H2C2 271 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 E5RGE8 158 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 CAMLGP49069 296 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ATP6V1FQ16864 119 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PATE2Q6UY27 113 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 C16orf92Q96LL3 132 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RARRES2Q99969 163 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 RNF24Q9Y225 148 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 H3BMM0 161 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-DRB4P13762 266 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 C4BPBP20851 252 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 OR11H2Q8NH07 326 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 C17orf77Q96MU5 243 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.54□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 H0YIZ8 118 aa14.53□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 COX7A2P2O60397 106 aa14.53□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 BAXQ07812 192 aa14.53□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.53□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTPS1-206ENST00000470271 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 DEFB1P60022 68 aa14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 NHLH2Q02577 135 aa14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 FGL1Q08830 312 aa14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 Q6ZRG5 221 aa14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.52□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 FGF7P21781 194 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PRR20EP86478 221 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PRR20CP86479 221 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PRR20DP86480 221 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PRR20BP86481 221 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PRR20AP86496 221 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 MIC13Q5XKP0 118 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RPRMQ9NS64 109 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 ALG5Q9Y673 324 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 TENM2Q9NT68 2774 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 MPC2O95563 127 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PET100P0DJ07 73 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 C20orf173Q96LM9 149 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.5□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 A0A087X0K7 114 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 MPDU1O75352 247 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 OPCMLQ14982 345 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RNF126Q9BV68 326 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.49□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 F6UB75 175 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV3-20P01619 116 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 B2MP61769 119 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PFDN5Q99471 154 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 A0A0J9YX75 114 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CLINT1Q14677 625 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 MORN5Q5VZ52 161 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 THAP6Q8TBB0 222 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 XCL2Q9UBD3 114 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RYR3Q15413 4870 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 FAM78BQ5VT40 261 aa14.46□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 RNF182Q8N6D2 247 aa14.46□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.46□□□□□ -0.09
CTPS1-206ENST00000470271 CXorf65A6NEN9 183 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-206ENST00000470271 CXCL3P19876 107 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-206ENST00000470271 MBD2Q9UBB5 411 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-206ENST00000470271 DEFB4AO15263 64 aa14.44□□□□□ -0.1
CTPS1-206ENST00000470271 MIFP14174 115 aa14.44□□□□□ -0.1
CTPS1-206ENST00000470271 CXCL2P19875 107 aa14.44□□□□□ -0.1
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