RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 INS-IGF2F8WCM5 200 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 CCL11P51671 97 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 THAP8Q8NA92 274 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 DPF1Q92782 380 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 LAMA5O15230 3695 aa10.8□□□□□ -0.68
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SH3BP1-206ENST00000469947 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
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SH3BP1-206ENST00000469947 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP1-206ENST00000469947 LGALS7P47929 136 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP1-206ENST00000469947 HSD52Q0P140 79 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf46Q8TAG6 207 aa10.74□□□□□ -0.69
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