RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467613.5

UBP1-208, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 5

Gene UBP1, Length 659 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-208	ENST00000467613	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613		A0A087X0K7	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613		A0A1W2PPV4	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	NPPC	P23582	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SLURP1	P55000	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TAS2R45	P59539	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	GPR82	Q96P67	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	METTL26	Q96S19	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	DOK5	Q9P104	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613		A0A1W2PS18	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CHEK1	O14757	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF253	O75346	499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CXorf1	O96002	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	HBE1	P02100	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CSN3	P07498	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CBLN1	P23435	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PSMB3	P49720	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CCL20	P78556	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PDE6H	Q13956	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613		A0A1W2PRX2	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OVOL1	O14753	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CD5	P06127	495 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FOLR2	P14207	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	EDN2	P20800	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	GCHFR	P30047	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MEOX2	P50222	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	RAB14	P61106	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	GUK1	Q16774	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	DPF1	Q92782	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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