RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465393.1

TNIK-208, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-208ENST00000465393 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.62□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.62□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 RNF24Q9Y225 148 aa14.62□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 NUPR2A6NF83 97 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 JTBO76095 146 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 SULT1A1P50225 295 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 DEFB1P60022 68 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 STX12Q86Y82 276 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 C17orf77Q96MU5 243 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 UHRF2Q96PU4 802 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 MGST2Q99735 147 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 RPRMQ9NS64 109 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 RYR3Q15413 4870 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 HBG1P69891 147 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 HBG2P69892 147 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 RAB31Q13636 194 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 PATE2Q6UY27 113 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 ARV1Q9H2C2 271 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 LYSTQ99698 3801 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 IGSF23A1L1A6 192 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 SIX6O95475 246 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 MIFP14174 115 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 S100A11P31949 105 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 CAMLGP49069 296 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 Q8NAQ8 132 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 NMES1Q9C002 83 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 MFFQ9GZY8 342 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 XCL2Q9UBD3 114 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIK-208ENST00000465393 A0A0J9YX75 114 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 DEFB4AO15263 64 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 IGKV3-20P01619 116 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 FGL1Q08830 312 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 VWC2Q2TAL6 325 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 C11orf45Q8TAV5 145 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 C20orf173Q96LM9 149 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 X6R8D5 127 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.57□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 COX7A2P2O60397 106 aa14.57□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 RLN2P04090 185 aa14.57□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 A0A087X0K7 114 aa14.56□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.56□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 F6UB75 175 aa14.56□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 ATP6V1FQ16864 119 aa14.56□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 FAM78BQ5VT40 261 aa14.56□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.56□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 E5RGE8 158 aa14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 PSG9Q00887 426 aa14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 BAXQ07812 192 aa14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 Q6ZRG5 221 aa14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 SSNA1O43805 119 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 FXYD7P58549 80 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 PRR20EP86478 221 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 PRR20CP86479 221 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 PRR20DP86480 221 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 PRR20BP86481 221 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 PRR20AP86496 221 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 MIC13Q5XKP0 118 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 ZNF709Q8N972 641 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.54□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 A8MTW9 85 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 OPCMLQ14982 345 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 RNF182Q8N6D2 247 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 PFDN5Q99471 154 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 HRH4Q9H3N8 390 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.53□□□□□ -0.08
TNIK-208ENST00000465393 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms