RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa15.23■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.22■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 H3BRN7 92 aa15.22■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 NHLH2Q02577 135 aa15.22■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 C10orf113Q5VZT2 155 aa15.22■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa15.22■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.22■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 LINC00052Q96N35 136 aa15.22■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 SPRY2O43597 315 aa15.21■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 IFNA5P01569 189 aa15.21■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 SPP1P10451 314 aa15.21■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 RPL12P30050 165 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 LINC00305Q7Z4B0 112 aa15.21■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 IL17DQ8TAD2 202 aa15.21■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.21■□□□□ 0.03
IMP4-209ENST00000462357 H0YIZ8 118 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 B2MP61769 119 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 ACTL10Q5JWF8 245 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 EBLN2Q6P2I7 272 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 FAM24BQ8N5W8 94 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 RNF126Q9BV68 326 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 RPRMQ9NS64 109 aa15.2■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.19■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 CLINT1Q14677 625 aa15.19■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 OXA1LQ15070 435 aa15.19■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.19■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.19■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.19■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 MBD2Q9UBB5 411 aa15.19■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 GIPP09681 153 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 CXCL3P19876 107 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 PRR20EP86478 221 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 PRR20CP86479 221 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 PRR20DP86480 221 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 PRR20BP86481 221 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 PRR20AP86496 221 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 FCN2Q15485 313 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 ZNF124Q15973 351 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 MIC13Q5XKP0 118 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 UHRF2Q96PU4 802 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 ATP5SQ99766 215 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 NPCDR1Q9BY65 106 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 HSPB11Q9Y547 144 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 PXMP4Q9Y6I8 212 aa15.18■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 CA1P00915 261 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 OPCMLQ14982 345 aa15.17■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 RNF183Q96D59 192 aa15.17■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 CLEC5AQ9NY25 188 aa15.17■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 C3orf84H3BNL1 204 aa15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 LYL1P12980 280 aa15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 CXCL2P19875 107 aa15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 DEFB135Q30KP9 77 aa15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 PATE2Q6UY27 113 aa15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 FOXI2Q6ZQN5 318 aa15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 OVOL2Q9BRP0 275 aa15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 KNCNA6PVL3 124 aa15.15■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 GUK1Q16774 197 aa15.15■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 OR11H7Q8NGC8 314 aa15.15■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 TMEM37Q8WXS4 190 aa15.15■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 COL7A1Q02388 2944 aa15.15■□□□□ 0.02
IMP4-209ENST00000462357 A0A087X0K7 114 aa15.14■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 LCN15Q6UWW0 184 aa15.14■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 RETNQ9HD89 108 aa15.14■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 H3BMM0 161 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 SOCS3O14543 225 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 HLA-DRB4P13762 266 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 ZNF266Q14584 549 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 MUC7Q8TAX7 377 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 RARRES2Q99969 163 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 SLC50A1Q9BRV3 221 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.13■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 CLUHP3Q96NS8 147 aa15.12■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 OR4B1Q8NGF8 309 aa15.11■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.11■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 HRH4Q9H3N8 390 aa15.11■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 EDA2RQ9HAV5 297 aa15.11■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 FAM78BQ5VT40 261 aa15.1■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 ZNF738Q8NE65 137 aa15.1■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.1■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.09■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 OR11H2Q8NH07 326 aa15.09■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 AQP10Q96PS8 301 aa15.09■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.09■□□□□ 0.01
IMP4-209ENST00000462357 STAB2Q8WWQ8 2551 aa15.08■□□□□ 0
IMP4-209ENST00000462357 PSG9Q00887 426 aa15.08■□□□□ 0
IMP4-209ENST00000462357 PSG3Q16557 428 aa15.08■□□□□ 0
IMP4-209ENST00000462357 TMEM14CQ9P0S9 112 aa15.08■□□□□ 0
IMP4-209ENST00000462357 A0A0J9YX75 114 aa15.07■□□□□ 0
IMP4-209ENST00000462357 AMBPP02760 352 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms