RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 IL18Q14116 193 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 TTC32Q5I0X7 151 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 GPR141Q7Z602 305 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 S100A7P31151 101 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 THAP8Q8NA92 274 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 UHRF2Q96PU4 802 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.18□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.18□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.18□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 C17orf77Q96MU5 243 aa7.18□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.17□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.17□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 EPM2AB3EWF7 344 aa7.16□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 OR5G3P0C626 314 aa7.16□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 M6PRP20645 277 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 VAMP1P23763 118 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 Q9H3A6 140 aa7.16□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.15□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 SYNGR2O43760 224 aa7.15□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 RLN2P04090 185 aa7.15□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 LINC00869P0C866 280 aa7.15□□□□□ -1.26
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DDX39B-211ENST00000449757 GAGE12GP0CL81 117 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 GAGE12IP0CL82 117 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 CDKN1BP46527 198 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC190Q86UF4 302 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.15□□□□□ -1.26
DDX39B-211ENST00000449757 SNURFLB1AK76 121 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-211ENST00000449757 H7BYZ3 331 aa7.14□□□□□ -1.27
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