RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2CO00762 179 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-202ENST00000379615 B2MP61769 119 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR20EP86478 221 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR20CP86479 221 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR20DP86480 221 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR20BP86481 221 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR20AP86496 221 aa11.41□□□□□ -0.58
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PGGT1B-202ENST00000379615 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-202ENST00000379615 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.41□□□□□ -0.58
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PGGT1B-202ENST00000379615 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
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PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.36□□□□□ -0.59
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PGGT1B-202ENST00000379615 TENM3Q9P273 2699 aa11.35□□□□□ -0.59
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PGGT1B-202ENST00000379615 SPP1P10451 314 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-202ENST00000379615 GUK1Q16774 197 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1B-202ENST00000379615 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1B-202ENST00000379615 LCN15Q6UWW0 184 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 HRH4Q9H3N8 390 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 WFDC1Q9HC57 220 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa11.32□□□□□ -0.6
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB135Q30KP9 77 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 MORN5Q5VZ52 161 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF183Q96D59 192 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 C17orf77Q96MU5 243 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 RETNQ9HD89 108 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.3□□□□□ -0.6
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