RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 TM4SF20Q53R12 229 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 TOR2AQ5JU69 321 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 MIR17HGQ75NE6 70 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 RNF125Q96EQ8 232 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 UFC1Q9Y3C8 167 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHS1-201ENST00000368547 A8MWP6 167 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf88P0DMB2 117 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 LYZP61626 148 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 KHDC3LQ587J8 217 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF506Q5JVG8 444 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 PQLC2Q6ZP29 291 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 OR1B1Q8NGR6 318 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 MANBALQ9NQG1 85 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 GNG13Q9P2W3 67 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 PEMTQ9UBM1 199 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 ARL14EPLP0DKL9 152 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 ORM2P19652 201 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 TREM1Q9NP99 234 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 DOK5Q9P104 306 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM213A2RRL7 107 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 BCL2P10415 239 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 CD33P20138 364 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 EDN2P20800 178 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00305Q7Z4B0 112 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 S100A7AQ86SG5 101 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 HIGD1AQ9Y241 93 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 K7EMT4 169 aa22.48■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa22.48■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM218A2RU14 115 aa22.47■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 C2orf70A6NJV1 201 aa22.47■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 HAGHQ16775 308 aa22.47■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 WFDC9Q8NEX5 89 aa22.47■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM231Q9H6L2 316 aa22.47■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 GCHFRP30047 84 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 ICAM4Q14773 271 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 STXBP6Q8NFX7 210 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 METTL26Q96S19 204 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 RARRES2Q99969 163 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 VAX2Q9UIW0 290 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 NPPCP23582 126 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 UHRF2Q96PU4 802 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 ELOVL1Q9BW60 279 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A2Q9BXI2 301 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM167BQ9NRX6 74 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 RABAC1Q9UI14 185 aa22.46■■□□□ 1.19
ECHS1-201ENST00000368547 CSN3P07498 182 aa22.45■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 CBLN1P23435 193 aa22.45■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SUN5Q8TC36 379 aa22.45■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa22.45■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa22.44■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa22.44■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 FOLR2P14207 255 aa22.44■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 MORN5Q5VZ52 161 aa22.44■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 IQCF2Q8IXL9 164 aa22.44■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 C9JQL5 133 aa22.43■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 CRYBB3P26998 211 aa22.43■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 PRR31Q5SQ13 230 aa22.43■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa22.43■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF503Q96F45 646 aa22.43■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00052Q96N35 136 aa22.43■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 OR7C2O60412 319 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 APOHP02749 345 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 S100A7P31151 101 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 TXNDC17Q9BRA2 123 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35B3Q9H1N7 401 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 RNF24Q9Y225 148 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SAP30O75446 220 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SMPXQ9UHP9 88 aa22.42■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 RXFP4Q8TDU9 374 aa22.41■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa22.41■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV5A0A0B4J249 113 aa22.4■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa22.4■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 H3BRN7 92 aa22.4■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SFTA3P0C7M3 94 aa22.4■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 C10orf91Q5T1B1 145 aa22.4■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SEC11CQ9BY50 192 aa22.4■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 PAXXQ9BUH6 204 aa22.39■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa22.39■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 OR51M1Q9H341 326 aa22.39■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa22.39■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 U3KQE9 123 aa22.39■■□□□ 1.18
ECHS1-201ENST00000368547 PAGE4O60829 102 aa22.39■■□□□ 1.17
ECHS1-201ENST00000368547 SRP19P09132 144 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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