RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 LGALS9O00182 355 aa9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 NPPCP23582 126 aa9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 HAGHQ16775 308 aa9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 RPEL1Q2QD12 228 aa9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TREM1Q9NP99 234 aa9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 A0A1W2PS18 150 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM218A2RU14 115 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 FAM74A7A6NL05 159 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM250H0YL14 139 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 BUB3O43684 328 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 IGLC2P0DOY2 106 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 MEOX2P50222 304 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 PDE6HQ13956 83 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 OR4F4Q96R69 305 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.57□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 A0A087WW49 117 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 A0A087X0K7 114 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 F6UZH7 168 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 LINC01619G3V211 115 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 PDE6DO43924 150 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 PAGE4O60829 102 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF253O75346 499 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 PYYP10082 97 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 BMI1P35226 326 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 CD81P60033 236 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 FOXL1Q12952 345 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 C1QL4Q86Z23 238 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 OR5B12Q96R08 314 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 RARRES2Q99969 163 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.56□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 C11orf94C9JXX5 98 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 OR10J4P0C629 311 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 CD28P10747 220 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 GALR1P47211 349 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 FHL3Q13643 280 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 LEMD1Q68G75 181 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 C11orf52Q96A22 123 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 SEC11CQ9BY50 192 aa9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 C9JQL5 133 aa9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 SFTA3P0C7M3 94 aa9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 MYCNOSP40205 109 aa9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 GLMPQ8WWB7 406 aa9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM213A2RRL7 107 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 GGTLC3B5MD39 225 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 H3BQ15 152 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 ATP5G3P48201 142 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 UBE2G2P60604 165 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 LINC01559Q495D7 138 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 CST9LP1Q5W188 147 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 DPF1Q92782 380 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 OTORQ9NRC9 128 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 SMPXQ9UHP9 88 aa9.53□□□□□ -0.88
CFDP1-201ENST00000283882 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.52□□□□□ -0.89
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF320A2RRD8 509 aa9.52□□□□□ -0.89
CFDP1-201ENST00000283882 HELTA6NFD8 242 aa9.52□□□□□ -0.89
CFDP1-201ENST00000283882 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CFDP1-201ENST00000283882 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.52□□□□□ -0.89
CFDP1-201ENST00000283882 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.52□□□□□ -0.89
CFDP1-201ENST00000283882 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.52□□□□□ -0.89
CFDP1-201ENST00000283882 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms