RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 HBBP68871 147 aa10.05□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.05□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 GRAMD2BQ96HH9 432 aa10.05□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 V9GYV3 84 aa10.05□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM189A5PLL7 270 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 C9JCJ5 164 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 PF4V1P10720 104 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF329Q86UD4 541 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 KLHDC1Q8N7A1 406 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 A6NNC1 897 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 LEPROTL1O95214 131 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 PATE2Q6UY27 113 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 TDGF1P3P51864 188 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 KCNS1Q96KK3 526 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 HTN1P15515 57 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 SLAQ13239 276 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 RIGQ13278 110 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 TDRG1Q3Y452 100 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 C8orf46Q8TAG6 207 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 RCHY1Q96PM5 261 aa10.04□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 TACC2O95359 2948 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 TCRAP04437 139 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 VAMP3Q15836 100 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 GNLYP22749 145 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 ATP5J2P56134 94 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 RNF151Q2KHN1 245 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 COX19Q49B96 90 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 NBL1P41271 181 aa10.03□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 EREGO14944 169 aa10.02□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 GOSR1O95249 250 aa10.02□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 FCER1GP30273 86 aa10.02□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 POU2AF1Q16633 256 aa10.02□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 AARDQ4LEZ3 155 aa10.02□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFAF3Q9BU61 184 aa10.02□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 RABAC1Q9UI14 185 aa10.02□□□□□ -0.8
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 UQCRFS1P47985 274 aa10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 NDPQ00604 133 aa10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZWC4 215 aa10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF503Q96F45 646 aa10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 C18orf15Q96N68 181 aa10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 YPEL4Q96NS1 127 aa10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 GNB1LQ9BYB4 327 aa10.02□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 PSG8Q9UQ74 426 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GWJ7 208 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 CBY3A6NI87 242 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 BMPR1BO00238 502 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 IGKV3-20P01619 116 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 RHOGP84095 191 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 G3V318 75 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 FXYD5Q96DB9 178 aa10.01□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 SRD5A1P18405 259 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 CKS2P33552 79 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 CDSNQ15517 529 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 C15orf32Q32M92 178 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 Q8N7P7 452 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 TSKUQ8WUA8 353 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 GLMPQ8WWB7 406 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 MTORP42345 2549 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 TRGV9Q99603 122 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 CHODLQ9H9P2 273 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 PRSS46E5RG02 174 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 PRSS1P07477 247 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 C3orf79P0CE67 100 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 CR1LQ2VPA4 569 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 NIT1Q86X76 327 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 C1orf159Q96HA4 380 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 C16orf92Q96LL3 132 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GUT8 65 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 PDLIM4P50479 330 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 KLK15Q9H2R5 256 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFB8O95169 186 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.99□□□□□ -0.81
UBXN4-201ENST00000272638 NCR2O95944 276 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms