RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H3BRN7 92 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV3-11P01762 117 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR10J4P0C629 311 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEBPGP53567 150 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF152Q8N8N0 203 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF414Q96IQ9 312 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR5B12Q96R08 314 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNB4Q9HAV0 340 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE6DO43924 150 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PYYP10082 97 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP5G3P48201 142 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PRX2 142 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 F6UZH7 168 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FXYD5Q96DB9 178 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNAPINO95295 136 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GP9P14770 177 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C12orf54Q6X4T0 127 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYOZ3Q8TDC0 251 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM14CQ9P0S9 112 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PRE2 83 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BMPR1BO00238 502 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 S100A7P31151 101 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LEMD1Q68G75 181 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RABAC1Q9UI14 185 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP5D1E7EU14 171 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARL3P36405 182 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF24Q9Y225 148 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF98A6NK75 572 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM209BQ5JX69 171 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C3orf56Q8N813 242 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CITED1Q99966 193 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCO1O75880 301 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE2E2Q96LR5 201 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H3BQ15 152 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRBV12-3P01733 135 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NBEAP1P0C6P0 100 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DEFB136Q30KP8 78 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF747Q9BV97 191 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PARLQ9H300 379 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF727A8MUV8 499 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GGTLC3B5MD39 225 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C8orf86Q6ZUL3 223 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C11orf52Q96A22 123 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPPCP23582 126 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TVP23CQ96ET8 276 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DUX3Q96PT4 197 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCO2A0A1W2PP80 73 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NDUFA4O00483 81 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF674Q2M3X9 581 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BLNKQ8WV28 456 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 M0R036 132 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GGCTO75223 188 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NDUFB4O95168 129 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLC2P0DOY2 106 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 METTL26Q96S19 204 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAT8Q9UHE5 227 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL7P18124 248 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYCNOSP40205 109 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCEAL7Q9BRU2 100 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ELOVL1Q9BW60 279 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RANP62826 216 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RHEBQ15382 184 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms