RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TCRAP04437 139 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PPIAL4GP0DN37 164 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 POU2AF1Q16633 256 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM133Q9H2Q1 129 aa10.71□□□□□ -0.69
TMOD1-201ENST00000259365 CACNA1AO00555 2505 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 E7EQL1 145 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 J3KRW8 73 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 PCP4P48539 62 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGFL2Q6UWQ7 119 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZS92 163 aa10.71□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087X0K7 114 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 THBDP07204 575 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 APOHP02749 345 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 MC5RP33032 325 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TEX45Q8NA69 505 aa10.7□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TIMM23O14925 209 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 GNG7O60262 68 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00614P0C842 121 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 COX19Q49B96 90 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 FA2HQ7L5A8 372 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 SORL1Q92673 2214 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV2-23P01705 113 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 SMKR1H3BMG3 65 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 ITGB1BP1O14713 200 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TM4SF20Q53R12 229 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 Q8TAT8 98 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 CHRDL1Q9BU40 450 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.69□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 OR5AL1P0C617 328 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 CT45A10P0DMU9 189 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 S100A7P31151 101 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 C18orf15Q96N68 181 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 CCL25O15444 150 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFB8O95169 186 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 CD3EP07766 207 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 LGALS7P47929 136 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 NHLH1Q02575 133 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 PIP4P1Q86T03 277 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF738Q8NE65 137 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 C8orf49Q96NF6 230 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa10.68□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 PSMB11A5LHX3 300 aa10.67□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 MBD6Q96DN6 1003 aa10.67□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 NCR2O95944 276 aa10.67□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 ESDP10768 282 aa10.67□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 C8orf46Q8TAG6 207 aa10.67□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 FAM106CPP0CH98 169 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 FAM106AQ4KMX7 169 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 RAB37Q96AX2 223 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 CHODLQ9H9P2 273 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 NGBQ9NPG2 151 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM213A2RRL7 107 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 OR2T8A6NH00 312 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 OR2J3O76001 311 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 ORM1P02763 201 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 CTRLP40313 264 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.66□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 FNDC10F2Z333 226 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 FAM208BQ5VWN6 2430 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 K7EQM0 130 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 HLA-DMBP28068 263 aa10.65□□□□□ -0.7
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GUT8 65 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD1-201ENST00000259365 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms