RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 UNCXA6NJT0 531 aa25.8■■□□□ 1.72
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SH3BP2-210ENST00000505941 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.8■■□□□ 1.72
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SH3BP2-210ENST00000505941 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
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SH3BP2-210ENST00000505941 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2-210ENST00000505941 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-210ENST00000505941 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
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SH3BP2-210ENST00000505941 CERS3Q8IU89 383 aa25.64■■□□□ 1.7
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